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    细胞转录组检测

    原创版权
    咨询量:  
    更新时间:2025-05-10  /
    咨询工程师

    信息概要

    细胞转录组检测是通过对细胞中RNA分子的全面分析,揭示基因表达水平、功能调控网络及细胞状态的关键技术。该检测服务可应用于疾病机制研究、药物开发、生物标志物筛选及个性化医疗等领域。通过高精度测序与生物信息学分析,能够提供从基因表达谱到调控通路的多维度数据,为科研与临床决策提供可靠依据。检测的重要性在于其能够解析复杂生物学过程,助力精准医学发展。

    检测项目

    • 全转录组测序(RNA-Seq)
    • 差异表达基因分析
    • 可变剪接事件检测
    • 非编码RNA表达谱
    • 单细胞转录组分析
    • 基因融合事件鉴定
    • 基因表达定量(FPKM/TPM)
    • 功能富集分析(GO/KEGG)
    • 长链非编码RNA(lncRNA)注释
    • 微小RNA(miRNA)靶标预测
    • 转录因子调控网络构建
    • RNA编辑位点检测
    • 细胞类型特异性标记识别
    • 基因共表达网络分析
    • 选择性多聚腺苷酸化分析
    • 外显子使用偏好性评估
    • 样本间表达相关性计算
    • RNA速度分析(动态转录组)
    • 病毒宿主互作基因挖掘
    • 细胞周期相关基因表达谱

    检测范围

    • 人类原代细胞
    • 哺乳动物细胞系
    • 植物细胞
    • 肿瘤组织单细胞
    • 免疫细胞亚群
    • 干细胞与分化细胞
    • 原核生物细胞
    • 神经细胞
    • 循环肿瘤细胞(CTC)
    • 病原体感染细胞
    • 类器官细胞
    • 胚胎发育阶段细胞
    • 药物处理细胞模型
    • 基因编辑细胞
    • 衰老相关细胞
    • 代谢异常细胞
    • 炎症微环境细胞
    • 表观遗传修饰细胞
    • 低温冻存复苏细胞
    • 3D培养细胞模型

    检测方法

    • 高通量测序技术(NGS):基于二代测序平台实现全转录组覆盖
    • 单细胞RNA捕获技术(10x Genomics):用于单细胞分辨率分析
    • 定量PCR(qRT-PCR):靶基因表达验证
    • 微阵列芯片技术:快速筛查已知基因表达模式
    • 纳米孔测序(Nanopore):长读长转录本分析
    • 链特异性建库:区分正义与反义转录本
    • SMART-seq:全长转录本扩增技术
    • Drop-seq:微流控单细胞分离技术
    • 空间转录组学:保留细胞空间位置信息
    • CAGE测序:准确识别转录起始位点
    • Ribo-depletion法:去除核糖体RNA干扰
    • UMI标记技术:消除PCR重复偏差
    • ATAC-seq整合分析:关联染色质开放状态
    • 代谢标记(4sU):检测新生RNA分子
    • 多重分子条形码技术:提高样本通量

    检测仪器

    • Illumina NovaSeq 6000
    • 10x Genomics Chromium
    • Oxford Nanopore GridION
    • Agilent 2100 Bioanalyzer
    • Qiagen Qubit荧光计
    • Thermo Fisher QuantStudio
    • Beckman Coulter MoFlo
    • BD FACSAria III
    • Nanodrop分光光度计
    • Covaris超声破碎仪
    • Bio-Rad PCR仪
    • Miltenyi gentleMACS
    • Takara SMARTer建库系统
    • PerkinElmer LabChip GX
    • Eppendorf离心机

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